Плательщики НДС, которые в соответствующем отчетном периоде имеют отрицательное значение НДС (налоговый кредит отчетного периода превышает сумму налоговых обязательств такого отчетного периода), могут заявить его к бюджетному возмещению. Но при этом следует учитывать ограничения, предусмотренные п. 200.4 НКУ, а именно:

• если есть налоговый долг по НДС, то сумма отрицательного значения в первую очередь засчитывается в погашение такого налогового долга;
• сумма НДС, которую заявляют к возмещению, должна быть фактически уплаченная в предыдущих и отчетном налоговых периодах поставщикам таких товаров/услуг или в бюджет;
• сумма заявленного возмещения не может превышать результат формулы (ΣНакл), исчисленной в соответствии с п. 200¹.3 НКУ на момент подачи налоговой декларации.

Кроме этого, налоговики настойчиво «рекомендуют» применять принцип хронологииформирования отрицательного значения, согласно которому налоговые обязательства текущего (отчетного) периода уменьшаются на сумму налогового кредита в хронологическом порядке его возникновения — от самого давнего до самого нового (см., например, ИНК ГФСУ [необходимо зарегистрироваться для просмотра ссылки] и письма ГФСУ [необходимо зарегистрироваться для просмотра ссылки] и [необходимо зарегистрироваться для просмотра ссылки]).

Так что, интересно: не помешает ли получению бюджетного возмещения налоговая накладная, которая была зарегистрирована в ЕРНН с нарушением предельного срока, установленного п. 201.10 НКУ?

Вот что на это ответили налоговики в ИНК ГФСУ от 19.07.20[необходимо зарегистрироваться для просмотра ссылки]

Сумма НДС, указанная в налоговой накладной, которая была несвоевременно зарегистрировано в ЕРНН, может быть включена в состав налогового кредита в налоговой отчетности по НДС за отчетный (налоговый) период, в котором такая налоговая накладная зарегистрирована в ЕРНН, или любого следующего отчетного (налогового) периода в пределах 1095 к. дн. с даты составления налоговой накладной. Соответственно, такая сумма НДС может участвовать в расчете суммы НДС, подлежащей бюджетному возмещению, начиная с периода отражения такой суммы в налоговой отчетности по НДС.

Стало быть, налоговики не против учета при расчете бюджетного возмещения сумм НДС с несвоевременно зарегистрированных в ЕРНН налоговых накладных, но только начиная с периода их отражение в НДС-декларации — периода регистрации в ЕРНН или любого последующего периода в пределах 1095 к. дн.