Заведено одно физ лицо. Проверил...
Сотрудник принят на 2 организации. Двумя отдельными документами "Приемы на работу в организацию" соответственно.
В этих двух документах, сотрудник был принят на одно и тоже подразделение по упр. учету. Я это исправил.
Теперь, при заполнении табличной части в документе начисления, дублирует не только в закладке "Проводки" - как раньше, но и в закладке "Расчет".
Но самое интересное, Подразделение по упр. учету разные. А по регл. учету - Одинаковые.