Как-то так
Запрос = Новый Запрос;
Запрос.УстановитьПараметр("Ссылка", СсылкаНаЭлементСправочникаГруппу);
Запрос.Текст = "ВЫБРАТЬ
| Номенклатура.Ссылка
|ИЗ
| Справочник.Номенклатура КАК Номенклатура
|ГДЕ
| Номенклатура.Родитель = &Ссылка
| И Номенклатура.ЭтоГруппа = ИСТИНА";
Если Запрос.Выполнить().Пустой() Тогда
Сообщить("Нет вложенных групп");
Иначе
Сообщить("Есть вложенные группы");
КонецЕсли;