Имеется такой медленно работающий код:

            Если СчетчикСтрок=КолвоСтрок тогда
                    МалаяОбласть=Новый ТабличныйДокумент;
                    МалаяОбласть.Вывести(Область);
                    МалаяОбласть.Вывести(ОбластьПодвал);
                    Если не ТабДок.ПроверитьВывод(МалаяОбласть) тогда
                        ТабДок.ВывестиГоризонтальныйРазделительСтраниц(); 
                    КонецЕсли;
                КонецЕсли;

Что бы тут изменить, чтобы стало работать быстрее?

Уберите проверку вывода.

А если именно она и нужна?

Ну тогда там нечего менять))

А что здесь проверка?

Проверяется подвал документа с последней строкой табличной части, чтобы подвал не отрывался от табличной части