Підкажіть, будь ласка, як правельно провести надання послуг по цивільно -правовій угоді, так щоб рахувалися податки і тягнуло у звітність.

Создайте вид расчета "договора ГПХ" и через начисление зп проведите.

Як саме і де це створюється?

Операции -> планы видов расчета-> основные начисления-> создаем новый вид расчета на закладке "база для расчетов" в ТЧ "является базой для" перечисляем налоги которые нужно удержать. Не забываем указать код ставки НДФЛ-а для 1ДФ.

Якщо проводити його як нарахування ЗП, то тоді мені потрібно буде внести працівника і прийняти його на роботу, а такого робити не можна.

а якщо я його не прийму то не проводяться розрахунки...

А вот мне стало интересно. Разве ГПХ не подразумевает автоматическое принятие человека на работу?

Нет. Тут несколько иной принцип.

Какой? Налоги удерживают и начисляют. С этого (помоему) года кроме НДФЛ появилось ЕСВ. Договор заключают. Трудовую разве что не берут.
Интересно для себя. Что этот договор ничего не дает?

В контексте основного вопроса применительно к бухгалтерии 1С, что мешает принять его на работу?

В принципе ничего.

А насчет ГПХ есть интересная темка - необходимо зарегистрироваться для просмотра ссылки можетlakilak будет интересно почитать...

Ну мы же тут говорим о конкретной конфе и о конкретном механизме. В БУ сделали так. А Вы уже решайте сами, принимать и проводить как конфигурацией предусмотрено, либо же начислить бух операцией и ручками отчеты заполнить.