в ут11 включен режим работы по заявкам на расходование денежных средств поэтому Списание дс не проводится без заявки
но в холдинге есть переводы дс между фирмами, заявки на такие перемещение не создаются.

как быть в этой ситуации?

Создавать заявки для и для таких случаев. Либо сделать доработку которая исключит эту конкретную проверку.