1С Предприятие 7.7(сетевая версия) - 7.70.027 БухУчет.
Для счета 601 в Конфигураторе добавил Субконто2, Субконто3. После создания Субконто3 - в Банковской Выписке не могу выбрать этот (601) счет.

Смотрим функцию УстДоступность() а именно

    
Если Счет.Выбран() = 1 Тогда
        Если Счет.КоличествоСубконто() = 0 Тогда
//......................................
        ИначеЕсли Счет.КоличествоСубконто() = 2 Тогда
    Форма.Субконто.Доступность(1);
    Форма.Заказ.Доступность(1);
        Иначе // вот тут!
    Если Лев(Счет.Код,3)<>"319" Тогда    
                          Счет = 0;
    КонецЕсли;    
КонецЕсли;

Тут ваш счет и обнуляется

В модуле БанковскойВыписки ограничено выбор счетов с количеством субконто больше 2. Допускается лишь указание 319 счета из всех счетов, имеющих 3 субконто. Подкорректируйте функцию УстДоступность() для разрешения добавления нужного счета с 3 субконто.

Ну да, почти вовремя.