В УПП есть прикол, связанный с документом "УстановкаПараметровУчетаНоменклатуры". Вот если он у Вас в системе заведен, то Ваши настройки счетов в регистре до лампочки. Некоторые подробности -
необходимо зарегистрироваться для просмотра ссылки. Общий смысл: "С даты первого проведенного документа «Установка параметров учета номенклатуры» будет действовать режим определения счетов при проведении документов.". Причем, в этом документе нет схемы реализации, но Система считает, что она её и так определит (в указанной Вами процедуре)
В модуле СчетаУчетаВДокументах ето зашито примерно тут:
Функция ПолучитьСчетаУчетаНоменклатурыИзНастроек(Организация, Номенклатура, Склад, Дата, ХозяйственнаяСитуация = "") Экспорт
Если ИспользоватьОпределениеСчетовПриПроведенииДокументов(Дата) Тогда
УстановленныеСчета = ПолучитьСчетаУчетаНоменклатурыИзДокумента(Организация, Дата, Номенклатура);
СтруктураСчетовУчета = ПолучитьСтруктуруСчетовУчета(Номенклатура, УстановленныеСчета, ХозяйственнаяСитуация);
Иначе
...
УстановленныеСчета = ПолучитьСчетаУчетаНоменклатурыИзРегистраСведений(Организация, Номенклатура, Склад);
...
КонецЕсли;
Возврат СтруктураСчетовУчета;
КонецФункции
Нужные нам счета из регистра сведений получаются, если не срабатывает "ИспользоватьОпределениеСчетовПриПроведенииДокументов"
Лично я считаю эту фишку вредной и никогда не использую
Совет такой:
1. Убедитесь, что у Вас в системе есть документ "УстановкаПараметровУчетаНоменклатуры". Перенесите его на какую-то дату, которая больше даты Вашего документа
2. Перезайдите в Базу(!это нужно сделать, параметр кэшируется). Попробуйте в документе перевыбрать Номенклатуру. Должна подставиться нужная Вам схема реализации
3. Если нет такого документа или не подставилась схема, тогда я не знаю