Почему при оформлении реализации через заказ покупателя (кнопка "оформить реализацию") если заказ проведен программа выдает "отсутствуют остатки товаров на складе", а если заказ не проведен-просто записан, выдает "невозможно провести реализацию. заказ выполнен". Товар на складе в свободном остатке есть.

Ну это правильно. Оформление ищет заказ в регистре, и если по нему нет остатка (т.е. заказ не проведен, или по нему полностью оформлена реализация) оно считает что заказ выполнен.
Насчет первого сообщения - в идеале оно возникает если все табличные части заказа пустые, тут надо визуально щупать.

Табличная часть заполнена полностью.

Со среды бьюсь над этой проблемой. Если завтра не будет положительного результата Шеф порвет как Тузик грелку!