Есть внешняя обработка. В модуле обработки прописаны экспортные процедуры. Как в управляемом приложении (тонкий клиент) выполнить эту экспортную процедуру внешней обработки?
Как вообще открыть управляемую форму внешней обработки?

Принцип такой-же как и с обычным.
Ограничение только по "Управляемое приложение" -> "Управляемое приложение", "Обыкновенный режим" -> "Обыкновенный режим".

А вообще читаем ЖКК.