Иногда не проводится отчет о розничных продажах, потому что в нескольких позициях номенклатуры пишет что недостаточно остатков на складе, но как тогда такой чек расчитывался и пробивался и что делать? Это ошибка конфигурации или проблемы в учете?

Могут быть варианты.
Либо проблемы в учете, либо сделали возврат поставщику (там нет контроля), либо возврат и продажа одного и того же товара (причем последнего) в одной смене.

Magister @ Вчера, 23:50 необходимо зарегистрироваться для просмотра ссылки ,
А возврат от покупателя влияет?

Это учётная ошибка. Контроль остатков товаров включен по складу включен?

Flexy @ Сегодня, 11:26 необходимо зарегистрироваться для просмотра ссылки ,

Insider12 @ Сегодня, 8:13 необходимо зарегистрироваться для просмотра ссылки ,
на возврате от покупателя я такого не ловил. только на рознице. что, впрочем, не доказывает что такого не может быть