Версия 1.3.1.10.
Создается следующие документы:
1. Заказ на производство
2. Отчёт производства за смену
3. Требование-накладная
Каждый последующий вводится на основании предыдущего.
Собственно затраты появляются во 2 и 3 документе, причем во втором они привязаны к номенклатуре из продукции, а в третьем - к номенклатуре материалов.
Почему так?
Беглый взгляд на код не показал изменения типового механизма, поэтому ошибка, вероятно, в методике ввода данных.

Сначала должно быть требование а потом отчет производства, или только отчет производства со списанием в нем материалов.

хм, я делал отдельно. Выпуск проходил раньше чем списаны материалы, потому как на производстве могут быть ситуации когда какие-то материалы рассчитываются исходя из количества выпущенной продукции.
Отчет распределения материалов не делал.
В конце дня формировался типовой документ распределения материалов в производстве. И проблем вроде не было.

по времени они расставлены 1, 3, 2.
А как заставить отчет списывать материалы? Какой-то глобальной константой?
Кстати, такая проблема возникает, когда продукция - это услуга.

Отчет производства за смену материалы не списывает (в УПП) какие именно затраты?

1. Требование накладная двигает РН "Затраты", а не НЗП, очевидно статья с характером затрат "общепроизводственные" или "административные", но то на ваше усмотрение. Если известен заказ - я бы списывал на прямые производственные, но это к вопросу не относится..
2. отчет производства за смену делает приход в затраты - очевидно у вас варинат выпуска установлен "на затраты" и получатели указаны.
Это нормальная ситуация, если это действительно внутренняя услуга, например списали гайки на ремонт (треб-накл), а отчетом стоимость ремонт распределили на продукцию. Это изменение аналитики затрат.

Опишите в двух словах что нужно получить

докопался до сути. Оказалось - типовой код меняли.