Подскажите и помогите!
Есть ли в УПП обработка, которая бы ночью запускалась и энные документы перепрододились за установленный период, типа отложенной задачи?

Обработка как раз стандартная - проведение документов. А механизм нужно использовать Регламентные задания.
В УПП есть регламентное задание Допроведение документов.
Для настройки можно использовать обработку КонсольЗаданий.epf с ИТС.
Да, еще желателно иметь клиент-серверную базу. С файловой будет сложнее.