Стоит задача настроить риб так , чтобы из 1 базы в другую , попадали только документы поступления с определенными реквизитами , например только те в которых стоит контрагент "ООО Ромашка" , стандартными методами как я понял это не реализовать. Попытался создать правила обмена, но не могу понять как написать код , и туда ли вообще я его пишу.

1) Почитайте мануал в самой КД влумчиво.
2) Создайте правило для выгрузки всех документов одного вида.
3) В ПКО перед выгрузкой добавте правлио выгрузки.

Лично у меня такое мнение, что РИБ здесь вообще "корова под седлом". Для такой задачи нужно использовать другие механизмы.

Я полагаю, автор не очень разбирается в предмете обсуждения и это на самом деле не РИБ, а обычный обмен.

КопаТЕ правила регистрации изменений. В организаии добавляеТЕ реквизит "ОсуществлятьОбмен", и при регистрации изменений проверяТЕ на необходимость обмена по конкретной организации.

базы, я так понимаю идентичные?
если реквизит документа, то в ПКО "Перед выгрузкой" что-то похожее пропишите

Если (ОбщегоНазначения.ЕстьРеквизитДокумента("Организация", Источник.Метаданные()) 
    И Источник.Организация <> Константы.ОрганизацияДляОбменаСБухБазой.Получить()) 
    тогда 
    Отказ=Истина;
КонецЕсли;