После импорта из УТ в БУ документа "Отчет о розничных продажах", он не проводится по причине "В строке номер "1" табличной части "Товары": Не заполнено значение реквизита "Налоговое назначение (доходов и затрат) "!". В УТ этого поля нету. По какому принципу его можно проставить (кроме как вручную). Буду очень благодарен за помощь!

При переносе задать какое-то правило заполнения этого реквизита. Как переносите данные?

Настроил обмен между УТ и БУ через ftp. Я тоже думал менять правила обмена, но надеялся что есть какието стандартные механизмы.

Если создать док руками и добавить этот товар - будет проводиться?

проводится

Вот только и налоговое назначение при вводе товара, наверное, проставляется.

Проставляется.
Может я что-то в настройках БУ не правельно указал, или не доуказал. Открыл обмен через Конвертацию данных, так там такого поля (Налоговое назначение (доходов и затрат)) и близко нету, и добавить новое правило с таким приемником не возможно.

Проверьте регистр сведений Счета учета номенклатуры в БУ, везде стоит налоговое назначение?

Скорее всего нужно перезалить конфигурацию БУ. И потом прописать код для заполнения налогового назначения