имеется довольно таки не маленькое предупреждение, и в нем необходимо каким то образом выделить части текста. имеется ли возможность окрасить этот текст в какой либо цвет, ну или на худой конец сделать жирным просто или подчеркнуть, но лучше конечно окрасить!

Сделать что то типа такого, но в синтаксисе 1С

Предупреждение(" текст" + [color="#00BFFF"]Текст[/color] + "текст");

Сам не пробовал, но думаю что не получиться таким макаром.
А вот FormEx по идее умеет.

Вот только что попробовал.Не совсем то, что нужно, но может пригодиться использование Врег

Предупреждение("Здравствуй уважаемый " + Врег("Юзер"));

Стандартными методами никак. можно сделать обработку в ней надпись и открывать.

метод "Врег" подойдет, делать обработку слишком жирно будет для етого сообщения еще и обработку, не такое уж и важное.
а вот как можно принудительно сделать чтоб в опредиленном месте начинал с новой строки?

Ну обработка это громко сказано Просто обработка с формой, даже внешняя.
РазделительСтрок

Предупреждение("За выбранный период итоги не рассчитаны!"+РазделительСтрок+
                       "Расчет итогов выполняется в режиме"+РазделительСтрок+
                     """Операции - Управление бухгалтерскими итогами"".");

Либо просто ("За выбранный период итоги не рассчитаны!
| Расчет итогов выполняется в режиме"

Предупреждение("Ля-ля-фа
|Эти ноты
|Ля-ля-фа
|Одиноки");