В одной базе открывается ассоциированный файл
ЗапуститьПриложение(МойПуть/МойФайл);
ВыполнитьКоманду(МойПуть/МойФайл)
Вопрос решен.
В конфигурации был отключены: Использовать синхронные вызовы и модальности.
Вместо ЗапуститьПриложение переписал на НачатьЗапускПриложения
Украинский 1С форум: всё про 1С 8.3, 1С 8.2, 1С 8.1, 1С 8.0, 1С 7.7
https://pro1c.org.ua