Не понятно пока, что такое белый а что черный учет. Но на форумах прочитала, что как раз управленческий учет (без слова "организации") - это белый учет. Вывод: в нашем случае (когда учет ведется по организации, где нет подчиненных организационных структур) следует заполнять те пары справочников и документов, где есть слово "организации".