Возникла проблема с комплексной конфигурацией: обновить с 009 релиза на сегодняшний 044.
Подскажите, пожалуйста, есть ли там критика, как с обновлением 266 -> 267 в бухучете.
Заранее спасибо за ответ(ы)

Есть, не помню какой релиз комплексной, но изменения касаются нового плана счетов. Сделайте копию, на ней попробуйте обновить сразу на 044. Иногда, если не вносились изменения и учет не мудреный, проходит.