Здравствуйте, подскажите, пожалуйста, 1С Предприятие 8.2 для бюджетных организаций почему при печати входящего договора в таблицу движения по договору два раза подтягивается НДС из документа поступления товара

Вообще бюджетных конфигураций две - у Вас комплексная или просто бухгалтерия? И изменялась ил конфигурация, конкретно печать договора.
Вы уверены что это именно НДС два раза? В движениях документ с НДС печатает двумя строками, сумма без НДС и НДС отдельно. Возможно у Вас некорректно веден именно сам документ поступления. Маловато исходной информации что бы дать более четкий ответ.

Я бюджетных конфигураций никогда не смотрел, но разве договор должен делать какие-то движения?

В документе поступления сумма без НДС 11,91, сумма НДС 2,38, всего 14,29. При печати договора в таблице движения по договору это поступление идет тремя строками - две строки НДС по 2,38, строка без НДС 11,91, сумма поступлений по договору увеличилась на эту лишнюю сумму НДС 2,38.
Конфигурация комплексная, печать договора не менялась

Перепровести документ пробовали? Это только с этим документом/договором или со всеми?

Такая ситуация со всеми договорами. Перепроводить пробовала.
Я прошу прощения, указала неправильную информацию по конфигупации:
1С: Предприятие 8.1 (8.1.15.14) конфигурация "Комплексный учет для бюджетных организаций Украины" ред 1.0

У меня отображается все как надо. Посему либо кто-то изменял конфигурацию или не корректно обновился, либо Вы что-то делаете неверно.