Всем известны ситуации, когда, например, на начало периода отчет на СКД светит остатки, хотя по факту их нет - такой же запрос через консоль запросов их не показывает.
В учебном видео Гилева есть на эту тему ответ - всегда работая с остаточными регистрами нужно выбирать еще и ПериодСекунда + правильно выставлять номер периода.

Всегда ли этого достаточно? Бывают ли еще другие необходимые настройки что бы СКД правильно рассчитала остатки?

Есть на итс статья "Типичные проблемы при расчете остатков" в рубрике "скд".

Попробуйте в ресурсах указать "Выражение"=НачалоПериода(&НачалоПериода,"День") и "Имя"=НачалоПериода и "Выражение"=КонецПериода(&КонецПериода,"День") и "Имя"=КонецПериода.

Параметры виртуальной таблицы Начало периода=&НачалоПериода. Конец периода=&КонецПериода. Периодичность=Регистратор.

Коллеги, большое спасибо за советы!!!