Добавил новое подразделение, необходимо оставить для пользователей этого подразделения доступ к номенклатуре, все остальные документы других подразделений должны быть закрыты для просмотра. Т.е. будет свой склад, своя касса, своя отчетность.

Если возможно - сделать это через файл конфигурации или TeamViewer

Стало сложно отслеживать сроки наступления оплаты всех клиентов. Необходима обработка, которая соотнесет документы Реализации товаров и услуг и Входящие платежные поручения/Приходные кассовые ордера и выдаст отчет, в котором будет указано погашена или нет накладная, если нет, то какой конечный срок оплаты, сумма к оплате, просрочена или нет. У разных клиентов разная отсрочка "30", "30-60", "30-60-90", разная валюта договора - гривна или евро, это нужно учесть.
Кроме того, сейчас у разных клиентов разная ситуация с расчетами- есть вообще без задолжености, есть с обычной текущей, есть с просроченой. Необходимо продумать точку старта, с которой будет вестись отсчет. Возможно установить дату, по происшествии которой все существующие накладные на сумму текущей задолжености будут считаться просрочеными, а для вновь созданых будут применяться стандартные условия отсрочки.

Это мои мысли. возможно у вас уже есть более совершенные наработки.